Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms