Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms