Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Dsg1bQ7TSF1 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Dsg1bQ7TSF1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Dsg1bQ7TSF1 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms