Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms