Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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