Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms