Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Pdzrn3Q69ZS0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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