Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms