Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms