Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms