Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Trim58Q5NCC9 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim58Q5NCC9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Trim58Q5NCC9 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim58Q5NCC9 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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