Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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