Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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D13Ertd608eQ3UPR8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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D13Ertd608eQ3UPR8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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D13Ertd608eQ3UPR8 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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D13Ertd608eQ3UPR8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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D13Ertd608eQ3UPR8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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D13Ertd608eQ3UPR8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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D13Ertd608eQ3UPR8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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D13Ertd608eQ3UPR8 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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