Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms