Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctsll3Q3ULP7 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ctsll3Q3ULP7 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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