Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms