Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shcbp1lQ3TTP0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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