Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms