Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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ptchd1Q14B62 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
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ptchd1Q14B62 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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ptchd1Q14B62 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
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ptchd1Q14B62 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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ptchd1Q14B62 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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ptchd1Q14B62 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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ptchd1Q14B62 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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ptchd1Q14B62 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms