Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MitfQ08874 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MitfQ08874 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
MitfQ08874 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MitfQ08874 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms