Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Tff1Q08423 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Tff1Q08423 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Tff1Q08423 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
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Tff1Q08423 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tff1Q08423 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tff1Q08423 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tff1Q08423 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tff1Q08423 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Tff1Q08423 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tff1Q08423 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tff1Q08423 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Tff1Q08423 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tff1Q08423 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tff1Q08423 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tff1Q08423 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tff1Q08423 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tff1Q08423 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tff1Q08423 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tff1Q08423 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tff1Q08423 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tff1Q08423 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tff1Q08423 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tff1Q08423 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tff1Q08423 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tff1Q08423 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tff1Q08423 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tff1Q08423 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tff1Q08423 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tff1Q08423 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tff1Q08423 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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