Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MestQ07646 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MestQ07646 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
MestQ07646 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
MestQ07646 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
MestQ07646 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
MestQ07646 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms