Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms