Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms