Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx2P81066 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx2P81066 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx2P81066 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx2P81066 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms