Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Csrnp1P59054 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp1P59054 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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