Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms