Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PctpP53808 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PctpP53808 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PctpP53808 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PctpP53808 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PctpP53808 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PctpP53808 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PctpP53808 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PctpP53808 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PctpP53808 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PctpP53808 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
PctpP53808 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PctpP53808 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PctpP53808 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms