Protein–RNA interactions for Protein: P47955

Rplp1, 60S acidic ribosomal protein P1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp1P47955 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms