Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms