Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mmp3P28862 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp3P28862 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp3P28862 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp3P28862 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp3P28862 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp3P28862 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp3P28862 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp3P28862 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp3P28862 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp3P28862 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp3P28862 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp3P28862 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp3P28862 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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