Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Atxn10P28658 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Atxn10P28658 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Atxn10P28658 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atxn10P28658 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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