Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18525 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18525 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18525 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18525 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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P18525 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18525 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18525 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18525 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18525 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18525 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18525 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18525 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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