Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtpraP18052 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtpraP18052 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.3 ms