Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms