Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Myod1P10085 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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