Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtaP09225 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
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