Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tgfb1P04202 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tgfb1P04202 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tgfb1P04202 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tgfb1P04202 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tgfb1P04202 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tgfb1P04202 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tgfb1P04202 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tgfb1P04202 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tgfb1P04202 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tgfb1P04202 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Tgfb1P04202 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tgfb1P04202 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tgfb1P04202 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tgfb1P04202 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tgfb1P04202 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tgfb1P04202 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tgfb1P04202 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tgfb1P04202 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tgfb1P04202 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tgfb1P04202 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tgfb1P04202 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tgfb1P04202 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tgfb1P04202 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Tgfb1P04202 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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