Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
EdaO54693 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
EdaO54693 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
EdaO54693 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
EdaO54693 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
EdaO54693 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
EdaO54693 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
EdaO54693 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
EdaO54693 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EdaO54693 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms