Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sdc4O35988 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sdc4O35988 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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