Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Efna3O08545 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Efna3O08545 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Efna3O08545 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Efna3O08545 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms