Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3278L7N2D2 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3278L7N2D2 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3278L7N2D2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3278L7N2D2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3278L7N2D2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3278L7N2D2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3278L7N2D2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3278L7N2D2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3278L7N2D2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3278L7N2D2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3278L7N2D2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3278L7N2D2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3278L7N2D2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3278L7N2D2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3278L7N2D2 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3278L7N2D2 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3278L7N2D2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3278L7N2D2 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm3278L7N2D2 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3278L7N2D2 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm3278L7N2D2 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm3278L7N2D2 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3278L7N2D2 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3278L7N2D2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3278L7N2D2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3278L7N2D2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3278L7N2D2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3278L7N2D2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3278L7N2D2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3278L7N2D2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm3278L7N2D2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm3278L7N2D2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3278L7N2D2 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3278L7N2D2 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3278L7N2D2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3278L7N2D2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3278L7N2D2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm3278L7N2D2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm3278L7N2D2 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm3278L7N2D2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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