Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Cst10-203ENSMUST00000109939 606 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Gm12146-201ENSMUST00000127604 518 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Ctdp1-203ENSMUST00000161003 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Gm8891-201ENSMUST00000198546 832 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 E330011O21Rik-201ENSMUST00000209468 1107 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Gm39231-201ENSMUST00000209813 501 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 AC155259.1-201ENSMUST00000214794 477 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 4930520K02Rik-202ENSMUST00000219658 396 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Lilrb4a-215ENSMUST00000220182 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 AC192333.4-201ENSMUST00000224269 981 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Olfr742-201ENSMUST00000089836 1120 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm37367-201ENSMUST00000191771 2602 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Tcf7l2-208ENSMUST00000111654 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Phf21a-207ENSMUST00000111293 3900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm11905-201ENSMUST00000117653 678 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms