Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
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