Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Gm21818J3KMS6 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Gm21818J3KMS6 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Gm21818J3KMS6 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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