Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Cldn20G5E8X0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Cldn20G5E8X0 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Cldn20G5E8X0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Cldn20G5E8X0 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Cldn20G5E8X0 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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