Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3002E9PW72 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3002E9PW72 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3002E9PW72 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3002E9PW72 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3002E9PW72 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3002E9PW72 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3002E9PW72 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3002E9PW72 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3002E9PW72 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3002E9PW72 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3002E9PW72 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3002E9PW72 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3002E9PW72 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3002E9PW72 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3002E9PW72 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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