Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms