Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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