Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Cldn8Q9Z260 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Cldn8Q9Z260 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Cldn8Q9Z260 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Cldn8Q9Z260 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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